TY  - JOUR
AU  - Koelsche, Christian
AU  - Schrimpf, Daniel
AU  - Stichel, Damian
AU  - Sill, Martin
AU  - Sahm, Felix
AU  - Reuss, David E
AU  - Blattner, Mirjam
AU  - Worst, Barbara
AU  - Heilig, Christoph E
AU  - Beck, Katja
AU  - Horak, Peter
AU  - Kreutzfeldt, Simon
AU  - Paff, Elke
AU  - Stark, Sebastian
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AU  - Ecker, Jonas
AU  - Sturm, Dominik
AU  - Pajtler, Kristian W
AU  - Reinhardt, Annekathrin
AU  - Wefers, Annika K
AU  - Sievers, Philipp
AU  - Ebrahimi, Azadeh
AU  - Suwala, Abigail
AU  - Fernández-Klett, Francisco
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AU  - Hovestadt, Volker
AU  - Kommoss, Felix K F
AU  - Kriegsmann, Mark
AU  - Schick, Matthias
AU  - Bewerunge-Hudler, Melanie
AU  - Milde, Till
AU  - Witt, Olaf
AU  - Kulozik, Andreas E
AU  - Kool, Marcel
AU  - Romero-Pérez, Laura
AU  - Grünewald, Thomas G P
AU  - Kirchner, Thomas
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AU  - Uhl, Matthias
AU  - Abdollahi, Amir
AU  - Debus, Jürgen
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AU  - Thomas, Christian
AU  - Hasselblatt, Martin
AU  - Paulus, Werner
AU  - Hartmann, Christian
AU  - Staszewski, Ori
AU  - Prinz, Marco
AU  - Hench, Jürgen
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AU  - Versleijen-Jonkers, Yvonne M H
AU  - Weidema, Marije E
AU  - Mentzel, Thomas
AU  - Griewank, Klaus
AU  - de Álava, Enrique
AU  - Martín, Juan Díaz
AU  - Gastearena, Miguel A Idoate
AU  - Chang, Kenneth Tou-En
AU  - Low, Sharon Yin Yee
AU  - Cuevas-Bourdier, Adrian
AU  - Mittelbronn, Michel
AU  - Mynarek, Martin
AU  - Rutkowski, Stefan
AU  - Schüller, Ulrich
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AU  - Snuderl, Matija
AU  - Büttner, Reinhard
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AU  - Lyskjær, Iben
AU  - Schirmacher, Peter
AU  - Stenzinger, Albrecht
AU  - Brors, Benedikt
AU  - Glimm, Hanno
AU  - Heining, Christoph
AU  - Tirado, Oscar M
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AU  - Mora, Jaume
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AU  - Del Muro, Xavier Garcia
AU  - Moran, Sebastian
AU  - Esteller, Manel
AU  - Benhamida, Jamal K
AU  - Ladanyi, Marc
AU  - Wardelmann, Eva
AU  - Antonescu, Cristina
AU  - Flanagan, Adrienne
AU  - Dirksen, Uta
AU  - Hohenberger, Peter
AU  - Baumhoer, Daniel
AU  - Hartmann, Wolfgang
AU  - Vokuhl, Christian
AU  - Flucke, Uta
AU  - Petersen, Iver
AU  - Mechtersheimer, Gunhild
AU  - Capper, David
AU  - Jones, David T W
AU  - Fröhling, Stefan
AU  - Pfister, Stefan M
AU  - von Deimling, Andreas
TI  - Sarcoma classification by DNA methylation profiling.
JO  - Nature Communications
VL  - 12
IS  - 1
SN  - 2041-1723
CY  - [London]
PB  - Nature Publishing Group UK
M1  - DKFZ-2021-00179
SP  - 498
PY  - 2021
N1  - #EA:B300#LA:B300#
AB  - Sarcomas are malignant soft tissue and bone tumours affecting adults, adolescents and children. They represent a morphologically heterogeneous class of tumours and some entities lack defining histopathological features. Therefore, the diagnosis of sarcomas is burdened with a high inter-observer variability and misclassification rate. Here, we demonstrate classification of soft tissue and bone tumours using a machine learning classifier algorithm based on array-generated DNA methylation data. This sarcoma classifier is trained using a dataset of 1077 methylation profiles from comprehensively pre-characterized cases comprising 62 tumour methylation classes constituting a broad range of soft tissue and bone sarcoma subtypes across the entire age spectrum. The performance is validated in a cohort of 428 sarcomatous tumours, of which 322 cases were classified by the sarcoma classifier. Our results demonstrate the potential of the DNA methylation-based sarcoma classification for research and future diagnostic applications.
LB  - PUB:(DE-HGF)16
C6  - pmid:33479225
DO  - DOI:10.1038/s41467-020-20603-4
UR  - https://inrepo02.dkfz.de/record/167188
ER  -