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AU  - Brenner, Hermann
AU  - Kaneva, Radka
AU  - Pandha, Hardev
TI  - KLK3 SNP-SNP interactions for prediction of prostate cancer aggressiveness.
JO  - Scientific reports
VL  - 11
IS  - 1
SN  - 2045-2322
CY  - [London]
PB  - Macmillan Publishers Limited, part of Springer Nature
M1  - DKFZ-2021-00987
SP  - 9264
PY  - 2021
AB  - Risk classification for prostate cancer (PCa) aggressiveness and underlying mechanisms remain inadequate. Interactions between single nucleotide polymorphisms (SNPs) may provide a solution to fill these gaps. To identify SNP-SNP interactions in the four pathways (the angiogenesis-, mitochondria-, miRNA-, and androgen metabolism-related pathways) associated with PCa aggressiveness, we tested 8587 SNPs for 20,729 cases from the PCa consortium. We identified 3 KLK3 SNPs, and 1083 (P < 3.5 × 10-9) and 3145 (P < 1 × 10-5) SNP-SNP interaction pairs significantly associated with PCa aggressiveness. These SNP pairs associated with PCa aggressiveness were more significant than each of their constituent SNP individual effects. The majority (98.6
LB  - PUB:(DE-HGF)16
C6  - pmid:33927218
C2  - pmc:PMC8084951
DO  - DOI:10.1038/s41598-021-85169-7
UR  - https://inrepo02.dkfz.de/record/168679
ER  -