Journal Article

DKFZ-2022-03156

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Deciphering colorectal cancer genetics through multi-omic analysis of 100,204 cases and 154,587 controls of European and east Asian ancestries.

Fernandez-Rozadilla, C. ; Timofeeva, M. ; Chen, Z. ; Law, P. ; Thomas, M. ; Schmit, S. ; Díez-Obrero, V. ; Hsu, L. ; Fernandez-Tajes, J. ; Palles, C. ; Sherwood, K. ; Briggs, S. ; Svinti, V. ; Donnelly, K. ; Farrington, S. ; Blackmur, J. ; Vaughan-Shaw, P. ; Shu, X.-O. ; Long, J. ; Cai, Q. ; Guo, X. ; Lu, Y. ; Broderick, P. ; Studd, J. ; Huyghe, J. ; Harrison, T. ; Conti, D. ; Dampier, C. ; Devall, M. ; Schumacher, F. ; Melas, M. ; Rennert, G. ; Obón-Santacana, M. ; Martín-Sánchez, V. ; Moratalla-Navarro, F. ; Oh, J. H. ; Kim, J. ; Jee, S. H. ; Jung, K. J. ; Kweon, S.-S. ; Shin, M.-H. ; Shin, A. ; Ahn, Y.-O. ; Kim, D.-H. ; Oze, I. ; Wen, W. ; Matsuo, K. ; Matsuda, K. ; Tanikawa, C. ; Ren, Z. ; Gao, Y.-T. ; Jia, W.-H. ; Hopper, J. ; Jenkins, M. ; Win, A. K. ; Pai, R. ; Figueiredo, J. ; Haile, R. ; Gallinger, S. ; Woods, M. ; Newcomb, P. ; Duggan, D. ; Cheadle, J. ; Kaplan, R. ; Maughan, T. ; Kerr, R. ; Kerr, D. ; Kirac, I. ; Böhm, J. ; Mecklin, L.-P. ; Jousilahti, P. ; Knekt, P. ; Aaltonen, L. ; Rissanen, H. ; Pukkala, E. ; Eriksson, J. ; Cajuso, T. ; Hänninen, U. ; Kondelin, J. ; Palin, K. ; Tanskanen, T. ; Renkonen-Sinisalo, L. ; Zanke, B. ; Männistö, S. ; Albanes, D. ; Weinstein, S. ; Ruiz-Narvaez, E. ; Palmer, J. ; Buchanan, D. ; Platz, E. ; Visvanathan, K. ; Ulrich, C. ; Siegel, E. ; Brezina, S. ; Gsur, A. ; Campbell, P. ; Chang-Claude, J.DKFZ* ; Hoffmeister, M.DKFZ* ; Brenner, H.DKFZ* ; Slattery, M. ; Potter, J. ; Tsilidis, K. ; Schulze, M. ; Gunter, M. ; Murphy, N. ; Castells, A. ; Castellví-Bel, S. ; Moreira, L. ; Arndt, V.DKFZ* ; Shcherbina, A. ; Stern, M. ; Pardamean, B. ; Bishop, T. ; Giles, G. ; Southey, M. ; Idos, G. ; McDonnell, K. ; Abu-Ful, Z. ; Greenson, J. ; Shulman, K. ; Lejbkowicz, F. ; Offit, K. ; Su, Y.-R. ; Steinfelder, R. ; Keku, T. ; van Guelpen, B. ; Hudson, T. ; Hampel, H. ; Pearlman, R. ; Berndt, S. ; Hayes, R. ; Martinez, M. E. ; Thomas, S. ; Corley, D. ; Pharoah, P. ; Larsson, S. ; Yen, Y. ; Lenz, H.-J. ; White, E. ; Li, L. ; Doheny, K. ; Pugh, E. ; Shelford, T. ; Chan, A. ; Cruz-Correa, M. ; Lindblom, A. ; Hunter, D. ; Joshi, A. ; Schafmayer, C. ; Scacheri, P. ; Kundaje, A. ; Nickerson, D. ; Schoen, R. ; Hampe, J. ; Stadler, Z. ; Vodicka, P. ; Vodickova, L. ; Vymetalkova, V. ; Papadopoulos, N. ; Edlund, C. ; Gauderman, W. ; Thomas, D. ; Shibata, D. ; Toland, A. ; Markowitz, S. ; Kim, A. ; Chanock, S. ; van Duijnhoven, F. ; Feskens, E. ; Sakoda, L. ; Gago-Dominguez, M. ; Wolk, A. ; Naccarati, A. ; Pardini, B. ; FitzGerald, L. ; Lee, S. C. ; Ogino, S. ; Bien, S. ; Kooperberg, C. ; Li, C. ; Lin, Y. ; Prentice, R. ; Qu, C. ; Bézieau, S. ; Tangen, C. ; Mardis, E. ; Yamaji, T. ; Sawada, N. ; Iwasaki, M. ; Haiman, C. ; Le Marchand, L. ; Wu, A. ; Qu, C. ; McNeil, C. ; Coetzee, G. ; Hayward, C. ; Deary, I. ; Harris, S. ; Theodoratou, E. ; Reid, S. ; Walker, M. ; Ooi, L. Y. ; Moreno, V. ; Casey, G. ; Gruber, S. ; Tomlinson, I. ; Zheng, W. ; Dunlop, M. ; Houlston, R. ; Peters, U.

2023
Macmillan Publishers Limited, part of Springer Nature London

This record in other databases:  

Please use a persistent id in citations: doi:10.1038/s41588-022-01222-9

Abstract: Colorectal cancer (CRC) is a leading cause of mortality worldwide. We conducted a genome-wide association study meta-analysis of 100,204 CRC cases and 154,587 controls of European and east Asian ancestry, identifying 205 independent risk associations, of which 50 were unreported. We performed integrative genomic, transcriptomic and methylomic analyses across large bowel mucosa and other tissues. Transcriptome- and methylome-wide association studies revealed an additional 53 risk associations. We identified 155 high-confidence effector genes functionally linked to CRC risk, many of which had no previously established role in CRC. These have multiple different functions and specifically indicate that variation in normal colorectal homeostasis, proliferation, cell adhesion, migration, immunity and microbial interactions determines CRC risk. Crosstissue analyses indicated that over a third of effector genes most probably act outside the colonic mucosa. Our findings provide insights into colorectal oncogenesis and highlight potential targets across tissues for new CRC treatment and chemoprevention strategies.

Note: 2023 Jan;55(1):89-99

---

Contributing Institute(s):

1. C070 Klinische Epidemiologie und Alternf. (C070)
2. Präventive Onkologie (C120)
3. DKTK HD zentral (HD01)
4. C020 Epidemiologie von Krebs (C020)

Research Program(s):

1. 313 - Krebsrisikofaktoren und Prävention (POF4-313) (POF4-313)

Appears in the scientific report 2022

---

Database coverage:
; BIOSIS Previews ; Biological Abstracts ; Clarivate Analytics Master Journal List ; Current Contents - Life Sciences ; DEAL Nature ; Ebsco Academic Search ; Essential Science Indicators ; IF >= 30 ; JCR ; Nationallizenz ; SCOPUS ; Science Citation Index Expanded ; Web of Science Core Collection

---