Journal Article DKFZ-2018-01244

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Association analyses of more than 140,000 men identify 63 new prostate cancer susceptibility loci.

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2018
Nature America New York, NY

Nature genetics 50(7), 928 - 936 () [10.1038/s41588-018-0142-8]
 GO

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Abstract: Genome-wide association studies (GWAS) and fine-mapping efforts to date have identified more than 100 prostate cancer (PrCa)-susceptibility loci. We meta-analyzed genotype data from a custom high-density array of 46,939 PrCa cases and 27,910 controls of European ancestry with previously genotyped data of 32,255 PrCa cases and 33,202 controls of European ancestry. Our analysis identified 62 novel loci associated (P < 5.0 × 10-8) with PrCa and one locus significantly associated with early-onset PrCa (≤55 years). Our findings include missense variants rs1800057 (odds ratio (OR) = 1.16; P = 8.2 × 10-9; G>C, p.Pro1054Arg) in ATM and rs2066827 (OR = 1.06; P = 2.3 × 10-9; T>G, p.Val109Gly) in CDKN1B. The combination of all loci captured 28.4% of the PrCa familial relative risk, and a polygenic risk score conferred an elevated PrCa risk for men in the ninetieth to ninety-ninth percentiles (relative risk = 2.69; 95% confidence interval (CI): 2.55-2.82) and first percentile (relative risk = 5.71; 95% CI: 5.04-6.48) risk stratum compared with the population average. These findings improve risk prediction, enhance fine-mapping, and provide insight into the underlying biology of PrCa1.

Classification:

Contributing Institute(s):
  1. Klinische Epidemiologie und Alternsforschung (C070)
  2. Genomische Epidemiologie (C055)
Research Program(s):
  1. 313 - Cancer risk factors and prevention (POF3-313) (POF3-313)

Appears in the scientific report 2018
Database coverage:
Medline ; BIOSIS Previews ; Current Contents - Life Sciences ; Ebsco Academic Search ; IF >= 30 ; JCR ; NCBI Molecular Biology Database ; NationallizenzNationallizenz ; SCOPUS ; Science Citation Index ; Science Citation Index Expanded ; Thomson Reuters Master Journal List ; Web of Science Core Collection
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 Record created 2018-08-29, last modified 2024-02-29



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