Journal Article

DKFZ-2024-02160

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png A community effort to optimize sequence-based deep learning models of gene regulation

Rafi, A. M. ; Nogina, D. ; Penzar, D. ; Lee, D. ; Lee, D. ; Kim, N. ; Kim, S. ; Kim, D. ; Shin, Y. ; Kwak, I.-Y. ; Meshcheryakov, G. ; Lando, A. ; Zinkevich, A. ; Kim, B.-C. ; Lee, J. ; Kang, T. ; Vaishnav, E. D. ; Yadollahpour, P. ; Bornelöv, S. ; Svensson, F. ; Trapotsi, M.-A. ; Tran, D. ; Nguyen, T. ; Tu, X. ; Zhang, W. ; Qiu, W. ; Ghotra, R. ; Yu, Y. ; Labelson, E. ; Prakash, A. ; Narayanan, A. ; Koo, P. ; Chen, X. ; Jones, D. T.DKFZ* ; Tinti, M. ; Guan, Y. ; Ding, M. ; Chen, K. ; Yang, Y. ; Ding, K. ; Dixit, G. ; Wen, J. ; Zhou, Z. ; Dutta, P. ; Sathian, R. ; Surana, P. ; Ji, Y. ; Liu, H. ; Davuluri, R. V. ; Hiratsuka, Y. ; Takatsu, M. ; Chen, T.-M. ; Huang, C.-H. ; Wang, H.-K. ; Shih, E. S. C. ; Chen, S.-H. ; Wu, C.-H. ; Chen, J.-Y. ; Huang, K.-L. ; Alsaggaf, I. ; Greaves, P. ; Barton, C. ; Wan, C. ; Abad, N.DKFZ* ; Körner, C.DKFZ* ; Feuerbach, L.DKFZ* ; Brors, B.DKFZ* ; Li, Y. ; Röner, S. ; Dash, P. M. ; Schubach, M. ; Soylemez, O. ; Møller, A. ; Kavaliauskaite, G. ; Madsen, J. ; Lu, Z. ; Queen, O. ; Babjac, A. ; Emrich, S. ; Kardamiliotis, K. ; Kyriakidis, K. ; Malousi, A. ; Palaniappan, A. ; Gupta, K. ; Kumar S, P. ; Bradford, J. ; Perrin, D. ; Salomone, R. ; Schmitz, C. ; JiaXing, C. ; JingZhe, W. ; AiWei, Y. ; Kim, S. ; Albrecht, J. ; Regev, A. ; Gong, W. ; Kulakovskiy, I. V. ; Meyer, P. ; de Boer, C. G.

2025
Springer Nature New York, NY

This record in other databases:  

Please use a persistent id in citations: doi:10.1038/s41587-024-02414-w

Note: 43, pages 1373–1383 (2025)

---

Contributing Institute(s):

1. Angewandte Bioinformatik (B330)
2. Molekulare Genomanalyse (B050)
3. Pädiatrische Gliomforschung (B360)

Research Program(s):

1. 312 - Funktionelle und strukturelle Genomforschung (POF4-312) (POF4-312)

Appears in the scientific report 2024

---

Database coverage:
; BIOSIS Previews ; Biological Abstracts ; Clarivate Analytics Master Journal List ; Current Contents - Agriculture, Biology and Environmental Sciences ; Current Contents - Life Sciences ; DEAL Nature ; Ebsco Academic Search ; Essential Science Indicators ; IF >= 40 ; JCR ; Nationallizenz ; SCOPUS ; Science Citation Index Expanded ; Web of Science Core Collection

---