Journal Article DKFZ-2019-00503

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Shared heritability and functional enrichment across six solid cancers.

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2019
Nature Publishing Group UK [London]

Nature Communications 10(1), 431 () [10.1038/s41467-018-08054-4]
 GO

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Abstract: Quantifying the genetic correlation between cancers can provide important insights into the mechanisms driving cancer etiology. Using genome-wide association study summary statistics across six cancer types based on a total of 296,215 cases and 301,319 controls of European ancestry, here we estimate the pair-wise genetic correlations between breast, colorectal, head/neck, lung, ovary and prostate cancer, and between cancers and 38 other diseases. We observed statistically significant genetic correlations between lung and head/neck cancer (rg = 0.57, p = 4.6 × 10-8), breast and ovarian cancer (rg = 0.24, p = 7 × 10-5), breast and lung cancer (rg = 0.18, p =1.5 × 10-6) and breast and colorectal cancer (rg = 0.15, p = 1.1 × 10-4). We also found that multiple cancers are genetically correlated with non-cancer traits including smoking, psychiatric diseases and metabolic characteristics. Functional enrichment analysis revealed a significant excess contribution of conserved and regulatory regions to cancer heritability. Our comprehensive analysis of cross-cancer heritability suggests that solid tumors arising across tissues share in part a common germline genetic basis.

Keyword(s): Neoplasm Proteins

Classification:

Contributing Institute(s):
  1. C070 Klinische Epidemiologie und Alternf. (C070)
  2. Präventive Onkologie (C120)
  3. Molekulare Epidemiologie (C080)
  4. C020 Epidemiologie von Krebs (C020)
  5. Molekulargenetik des Mammakarzinoms (B072)
  6. Epigenomik (B370)
  7. DKTK Heidelberg (L101)
  8. DKTK Tübingen (L801)
  9. DKTK München (L701)
Research Program(s):
  1. 319H - Addenda (POF3-319H) (POF3-319H)

Appears in the scientific report 2019
Database coverage:
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 Record created 2019-02-25, last modified 2024-02-29


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